配合学科调整，对基地进行了重新规划，依据面向主产区和充分利用农科院现有基地的原则，规划了建设五个基地，其中三个新建，两个利用农科院现有基地。
野外台站（基地）
西南云南大理基地：2012年通过无偿划拨获得土地162亩，已拿到土地证，目前一期建设基本完成。
中南湖南湘潭基地：2015年12月通过无偿划拨获得土地130亩，已拿到土地证，目前一期建设批复2300万元，2017年批复400余万元。
华北山东庆云基地：2016年8月26与庆云县政府签订协议，庆云无偿划拨给我所1060亩土地，目前已经纳入农业部十三五基本建设规划。
东北黑土基地：利用哈兽研的综合试验基地，已经谈好，划100-200亩由环保所使用。
西北基地：利用兰州牧药所的基地，已经接触，划100-200亩由环保所使用（或院西部中心）。
大理综合实验站
湘潭实验站
山东庆云实验基地
